Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC41.43■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC41.43■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC41.42■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC41.41■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
TRIM41Q8WV44 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC41.38■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC41.37■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC41.36■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
TRIM41Q8WV44 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
TRIM41Q8WV44 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
TRIM41Q8WV44 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
TRIM41Q8WV44 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
TRIM41Q8WV44 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
TRIM41Q8WV44 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
TRIM41Q8WV44 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC41.3■■■■■ 4.2
TRIM41Q8WV44 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC41.29■■■■■ 4.2
TRIM41Q8WV44 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
TRIM41Q8WV44 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
TRIM41Q8WV44 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
TRIM41Q8WV44 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
TRIM41Q8WV44 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
TRIM41Q8WV44 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
TRIM41Q8WV44 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
TRIM41Q8WV44 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
TRIM41Q8WV44 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
TRIM41Q8WV44 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
TRIM41Q8WV44 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
TRIM41Q8WV44 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms