Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms