Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DTX3LQ8TDB6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms