Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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NEK9Q8TD19 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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NEK9Q8TD19 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
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NEK9Q8TD19 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
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NEK9Q8TD19 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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NEK9Q8TD19 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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NEK9Q8TD19 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEK9Q8TD19 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
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