Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY2

RFWD2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, humanhuman

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD2Q8NHY2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFWD2Q8NHY2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFWD2Q8NHY2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFWD2Q8NHY2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFWD2Q8NHY2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFWD2Q8NHY2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFWD2Q8NHY2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFWD2Q8NHY2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms