Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE62

CHDH, Choline dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHDHQ8NE62 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHDHQ8NE62 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHDHQ8NE62 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHDHQ8NE62 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHDHQ8NE62 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHDHQ8NE62 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHDHQ8NE62 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHDHQ8NE62 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHDHQ8NE62 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHDHQ8NE62 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHDHQ8NE62 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHDHQ8NE62 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.8 ms