Protein–RNA interactions for Protein: Q8N183

NDUFAF2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF2Q8N183 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDUFAF2Q8N183 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDUFAF2Q8N183 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFAF2Q8N183 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFAF2Q8N183 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFAF2Q8N183 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFAF2Q8N183 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFAF2Q8N183 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFAF2Q8N183 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFAF2Q8N183 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFAF2Q8N183 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFAF2Q8N183 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFAF2Q8N183 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFAF2Q8N183 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFAF2Q8N183 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NDUFAF2Q8N183 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDUFAF2Q8N183 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms