Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPAS3Q8IXF0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPAS3Q8IXF0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NPAS3Q8IXF0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms