Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP29

PQLC2, Lysosomal amino acid transporter 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC2Q6ZP29 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PQLC2Q6ZP29 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PQLC2Q6ZP29 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PQLC2Q6ZP29 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PQLC2Q6ZP29 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PQLC2Q6ZP29 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PQLC2Q6ZP29 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PQLC2Q6ZP29 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PQLC2Q6ZP29 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PQLC2Q6ZP29 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PQLC2Q6ZP29 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PQLC2Q6ZP29 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PQLC2Q6ZP29 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PQLC2Q6ZP29 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PQLC2Q6ZP29 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PQLC2Q6ZP29 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PQLC2Q6ZP29 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PQLC2Q6ZP29 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PQLC2Q6ZP29 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PQLC2Q6ZP29 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms