Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPP4R4Q6NUP7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms