Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MRNIPQ6NTE8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MRNIPQ6NTE8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms