Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPRIN2Q6IMN6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAPRIN2Q6IMN6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms