Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRAMD4Q6IC98 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRAMD4Q6IC98 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRAMD4Q6IC98 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms