Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA2Q69YH5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA2Q69YH5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA2Q69YH5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA2Q69YH5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA2Q69YH5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA2Q69YH5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA2Q69YH5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA2Q69YH5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA2Q69YH5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA2Q69YH5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA2Q69YH5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA2Q69YH5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA2Q69YH5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDCA2Q69YH5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms