Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
C1orf53Q5VUE5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
C1orf53Q5VUE5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms