Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4DIPQ5VU43 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4DIPQ5VU43 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4DIPQ5VU43 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4DIPQ5VU43 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4DIPQ5VU43 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4DIPQ5VU43 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4DIPQ5VU43 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4DIPQ5VU43 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4DIPQ5VU43 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4DIPQ5VU43 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4DIPQ5VU43 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4DIPQ5VU43 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4DIPQ5VU43 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4DIPQ5VU43 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE4DIPQ5VU43 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4DIPQ5VU43 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms