Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF17Q5VTA0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF17Q5VTA0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms