Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SOGA3Q5TF21 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SOGA3Q5TF21 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SOGA3Q5TF21 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms