Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAB7

RIPPLY2, Protein ripply2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY2Q5TAB7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPPLY2Q5TAB7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPPLY2Q5TAB7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPPLY2Q5TAB7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPPLY2Q5TAB7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPPLY2Q5TAB7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPPLY2Q5TAB7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPPLY2Q5TAB7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPPLY2Q5TAB7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPPLY2Q5TAB7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPPLY2Q5TAB7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPPLY2Q5TAB7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPPLY2Q5TAB7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPPLY2Q5TAB7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPPLY2Q5TAB7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPPLY2Q5TAB7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPPLY2Q5TAB7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPPLY2Q5TAB7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPPLY2Q5TAB7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPPLY2Q5TAB7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RIPPLY2Q5TAB7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIPPLY2Q5TAB7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPPLY2Q5TAB7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY2Q5TAB7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms