Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF19Q5T6S3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF19Q5T6S3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF19Q5T6S3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF19Q5T6S3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF19Q5T6S3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF19Q5T6S3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF19Q5T6S3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF19Q5T6S3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF19Q5T6S3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF19Q5T6S3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF19Q5T6S3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF19Q5T6S3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF19Q5T6S3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF19Q5T6S3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF19Q5T6S3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF19Q5T6S3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF19Q5T6S3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF19Q5T6S3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF19Q5T6S3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms