Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFAIP8L3Q5GJ75 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms