Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZC3H12AQ5D1E8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZC3H12AQ5D1E8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms