Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q1T7F1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q1T7F1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q1T7F1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q1T7F1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q1T7F1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q1T7F1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q1T7F1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q1T7F1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q1T7F1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q1T7F1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q1T7F1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q1T7F1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q1T7F1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q1T7F1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q1T7F1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q1T7F1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q1T7F1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q1T7F1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q1T7F1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q1T7F1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q1T7F1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q1T7F1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q1T7F1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q1T7F1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q1T7F1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q1T7F1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q1T7F1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q1T7F1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q1T7F1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q1T7F1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q1T7F1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q1T7F1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q1T7F1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q1T7F1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q1T7F1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q1T7F1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q1T7F1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q1T7F1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q1T7F1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q1T7F1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q1T7F1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q1T7F1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q1T7F1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q1T7F1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q1T7F1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q1T7F1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q1T7F1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q1T7F1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q1T7F1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q1T7F1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q1T7F1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q1T7F1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q1T7F1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q1T7F1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q1T7F1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q1T7F1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q1T7F1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q1T7F1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q1T7F1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q1T7F1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q1T7F1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q1T7F1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q1T7F1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q1T7F1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q1T7F1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q1T7F1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q1T7F1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q1T7F1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q1T7F1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q1T7F1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q1T7F1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q1T7F1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q1T7F1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q1T7F1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q1T7F1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q1T7F1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q1T7F1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q1T7F1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q1T7F1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q1T7F1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q1T7F1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q1T7F1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q1T7F1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q1T7F1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q1T7F1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q1T7F1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q1T7F1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q1T7F1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q1T7F1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q1T7F1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q1T7F1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q1T7F1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q1T7F1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q1T7F1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q1T7F1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q1T7F1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q1T7F1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q1T7F1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q1T7F1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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