Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC142Q17RM4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC142Q17RM4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC142Q17RM4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
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