Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDO1Q16878 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDO1Q16878 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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