Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTPRKQ15262 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPRKQ15262 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPRKQ15262 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPRKQ15262 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPRKQ15262 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPRKQ15262 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PTPRKQ15262 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PTPRKQ15262 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPRKQ15262 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPRKQ15262 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPRKQ15262 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPRKQ15262 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PTPRKQ15262 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
PTPRKQ15262 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
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