Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1D2Q14995 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1D2Q14995 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1D2Q14995 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1D2Q14995 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1D2Q14995 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1D2Q14995 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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