Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTAN1Q13813 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTAN1Q13813 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
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