Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKP2Q13309 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKP2Q13309 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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