Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRDNQ13061 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRDNQ13061 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRDNQ13061 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
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