Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNP2Q05952 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms