Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC25A11Q02978 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC25A11Q02978 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC25A11Q02978 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms