Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF8Q02556 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms