Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX1P78414 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX1P78414 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRX1P78414 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRX1P78414 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRX1P78414 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRX1P78414 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX1P78414 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX1P78414 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX1P78414 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX1P78414 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX1P78414 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX1P78414 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX1P78414 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX1P78414 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX1P78414 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX1P78414 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX1P78414 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX1P78414 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX1P78414 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX1P78414 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX1P78414 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX1P78414 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX1P78414 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX1P78414 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX1P78414 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX1P78414 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX1P78414 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX1P78414 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX1P78414 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX1P78414 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX1P78414 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX1P78414 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX1P78414 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX1P78414 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX1P78414 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX1P78414 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX1P78414 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX1P78414 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX1P78414 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX1P78414 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX1P78414 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX1P78414 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX1P78414 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX1P78414 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX1P78414 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX1P78414 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX1P78414 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX1P78414 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX1P78414 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX1P78414 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX1P78414 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX1P78414 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX1P78414 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX1P78414 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX1P78414 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX1P78414 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX1P78414 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX1P78414 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX1P78414 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX1P78414 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX1P78414 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX1P78414 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX1P78414 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX1P78414 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX1P78414 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX1P78414 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX1P78414 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX1P78414 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX1P78414 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX1P78414 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX1P78414 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX1P78414 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX1P78414 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX1P78414 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX1P78414 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX1P78414 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX1P78414 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX1P78414 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX1P78414 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX1P78414 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX1P78414 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX1P78414 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX1P78414 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX1P78414 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX1P78414 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX1P78414 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX1P78414 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX1P78414 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX1P78414 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX1P78414 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX1P78414 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX1P78414 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX1P78414 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX1P78414 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX1P78414 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX1P78414 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX1P78414 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX1P78414 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX1P78414 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms