Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL39P62891 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL39P62891 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL39P62891 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL39P62891 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL39P62891 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL39P62891 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL39P62891 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL39P62891 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL39P62891 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL39P62891 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL39P62891 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL39P62891 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL39P62891 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL39P62891 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL39P62891 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL39P62891 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL39P62891 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL39P62891 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL39P62891 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL39P62891 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL39P62891 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL39P62891 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P62891 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P62891 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P62891 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P62891 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P62891 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P62891 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P62891 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P62891 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL39P62891 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P62891 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P62891 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P62891 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P62891 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P62891 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P62891 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P62891 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P62891 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P62891 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P62891 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P62891 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P62891 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P62891 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P62891 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P62891 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P62891 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL39P62891 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P62891 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P62891 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P62891 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P62891 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P62891 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P62891 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P62891 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P62891 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P62891 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P62891 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P62891 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P62891 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P62891 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P62891 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P62891 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P62891 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL39P62891 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL39P62891 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL39P62891 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL39P62891 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL39P62891 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL39P62891 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL39P62891 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL39P62891 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL39P62891 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL39P62891 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL39P62891 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL39P62891 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL39P62891 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL39P62891 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL39P62891 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL39P62891 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL39P62891 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL39P62891 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL39P62891 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL39P62891 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL39P62891 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL39P62891 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL39P62891 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL39P62891 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL39P62891 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL39P62891 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL39P62891 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL39P62891 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL39P62891 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL39P62891 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL39P62891 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL39P62891 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL39P62891 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL39P62891 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL39P62891 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms