Protein–RNA interactions for Protein: P62277

RPS13, 40S ribosomal protein S13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS13P62277 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS13P62277 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS13P62277 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS13P62277 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS13P62277 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS13P62277 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS13P62277 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS13P62277 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS13P62277 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS13P62277 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS13P62277 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS13P62277 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS13P62277 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS13P62277 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS13P62277 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS13P62277 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS13P62277 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS13P62277 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS13P62277 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS13P62277 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS13P62277 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS13P62277 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS13P62277 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS13P62277 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS13P62277 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS13P62277 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS13P62277 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS13P62277 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS13P62277 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS13P62277 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS13P62277 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS13P62277 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS13P62277 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS13P62277 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS13P62277 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS13P62277 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS13P62277 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS13P62277 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS13P62277 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS13P62277 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS13P62277 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS13P62277 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS13P62277 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS13P62277 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS13P62277 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS13P62277 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS13P62277 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS13P62277 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS13P62277 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS13P62277 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS13P62277 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS13P62277 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS13P62277 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS13P62277 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS13P62277 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS13P62277 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS13P62277 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS13P62277 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS13P62277 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS13P62277 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS13P62277 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS13P62277 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS13P62277 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS13P62277 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS13P62277 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS13P62277 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS13P62277 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS13P62277 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS13P62277 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS13P62277 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS13P62277 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS13P62277 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS13P62277 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS13P62277 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS13P62277 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS13P62277 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS13P62277 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS13P62277 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS13P62277 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS13P62277 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS13P62277 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS13P62277 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS13P62277 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS13P62277 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS13P62277 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS13P62277 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS13P62277 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS13P62277 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS13P62277 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS13P62277 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS13P62277 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS13P62277 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS13P62277 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS13P62277 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS13P62277 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS13P62277 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS13P62277 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS13P62277 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS13P62277 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS13P62277 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms