Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOAP61586 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOAP61586 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOAP61586 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOAP61586 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOAP61586 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOAP61586 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOAP61586 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOAP61586 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOAP61586 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOAP61586 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOAP61586 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOAP61586 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOAP61586 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOAP61586 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOAP61586 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOAP61586 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOAP61586 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOAP61586 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOAP61586 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOAP61586 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOAP61586 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOAP61586 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOAP61586 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOAP61586 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOAP61586 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOAP61586 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOAP61586 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOAP61586 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOAP61586 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOAP61586 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOAP61586 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOAP61586 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOAP61586 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOAP61586 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOAP61586 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOAP61586 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOAP61586 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOAP61586 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOAP61586 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOAP61586 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOAP61586 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOAP61586 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOAP61586 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOAP61586 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOAP61586 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOAP61586 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOAP61586 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOAP61586 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOAP61586 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOAP61586 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOAP61586 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOAP61586 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOAP61586 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOAP61586 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOAP61586 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOAP61586 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOAP61586 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOAP61586 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOAP61586 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOAP61586 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOAP61586 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOAP61586 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOAP61586 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOAP61586 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOAP61586 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOAP61586 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOAP61586 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOAP61586 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOAP61586 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOAP61586 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOAP61586 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOAP61586 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOAP61586 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOAP61586 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOAP61586 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOAP61586 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOAP61586 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOAP61586 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOAP61586 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOAP61586 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOAP61586 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOAP61586 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOAP61586 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOAP61586 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOAP61586 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RHOAP61586 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOAP61586 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOAP61586 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOAP61586 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOAP61586 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOAP61586 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOAP61586 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOAP61586 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOAP61586 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOAP61586 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOAP61586 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOAP61586 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOAP61586 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOAP61586 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms