Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AQP4P55087 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AQP4P55087 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AQP4P55087 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AQP4P55087 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AQP4P55087 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AQP4P55087 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AQP4P55087 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AQP4P55087 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AQP4P55087 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AQP4P55087 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AQP4P55087 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AQP4P55087 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AQP4P55087 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AQP4P55087 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AQP4P55087 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AQP4P55087 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AQP4P55087 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AQP4P55087 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AQP4P55087 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AQP4P55087 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AQP4P55087 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AQP4P55087 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AQP4P55087 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AQP4P55087 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AQP4P55087 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AQP4P55087 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AQP4P55087 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AQP4P55087 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AQP4P55087 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AQP4P55087 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AQP4P55087 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AQP4P55087 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AQP4P55087 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AQP4P55087 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AQP4P55087 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AQP4P55087 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AQP4P55087 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AQP4P55087 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AQP4P55087 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AQP4P55087 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AQP4P55087 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AQP4P55087 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AQP4P55087 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AQP4P55087 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AQP4P55087 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AQP4P55087 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AQP4P55087 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AQP4P55087 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AQP4P55087 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AQP4P55087 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AQP4P55087 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AQP4P55087 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AQP4P55087 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AQP4P55087 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AQP4P55087 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AQP4P55087 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AQP4P55087 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AQP4P55087 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AQP4P55087 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AQP4P55087 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AQP4P55087 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AQP4P55087 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AQP4P55087 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AQP4P55087 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AQP4P55087 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AQP4P55087 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AQP4P55087 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AQP4P55087 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AQP4P55087 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AQP4P55087 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AQP4P55087 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AQP4P55087 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AQP4P55087 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AQP4P55087 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AQP4P55087 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AQP4P55087 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AQP4P55087 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AQP4P55087 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AQP4P55087 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AQP4P55087 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AQP4P55087 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AQP4P55087 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AQP4P55087 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AQP4P55087 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AQP4P55087 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AQP4P55087 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AQP4P55087 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AQP4P55087 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AQP4P55087 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AQP4P55087 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AQP4P55087 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AQP4P55087 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AQP4P55087 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AQP4P55087 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AQP4P55087 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AQP4P55087 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AQP4P55087 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AQP4P55087 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AQP4P55087 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms