Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB1P54762 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms