Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAD23AP54725 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23AP54725 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23AP54725 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms