Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDKN1CP49918 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKN1CP49918 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDKN1CP49918 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKN1CP49918 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKN1CP49918 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKN1CP49918 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKN1CP49918 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKN1CP49918 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKN1CP49918 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKN1CP49918 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKN1CP49918 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKN1CP49918 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKN1CP49918 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKN1CP49918 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.8 ms