Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPCAL1P37235 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPCAL1P37235 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HPCAL1P37235 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPCAL1P37235 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPCAL1P37235 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPCAL1P37235 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPCAL1P37235 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPCAL1P37235 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPCAL1P37235 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPCAL1P37235 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPCAL1P37235 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPCAL1P37235 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPCAL1P37235 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPCAL1P37235 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HPCAL1P37235 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HPCAL1P37235 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HPCAL1P37235 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HPCAL1P37235 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPCAL1P37235 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms