Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHKAP35790 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHKAP35790 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHKAP35790 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHKAP35790 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHKAP35790 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHKAP35790 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHKAP35790 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHKAP35790 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHKAP35790 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHKAP35790 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHKAP35790 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHKAP35790 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHKAP35790 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHKAP35790 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHKAP35790 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHKAP35790 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHKAP35790 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHKAP35790 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHKAP35790 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHKAP35790 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHKAP35790 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHKAP35790 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHKAP35790 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHKAP35790 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHKAP35790 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHKAP35790 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHKAP35790 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHKAP35790 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHKAP35790 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHKAP35790 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHKAP35790 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHKAP35790 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHKAP35790 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHKAP35790 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHKAP35790 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHKAP35790 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHKAP35790 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHKAP35790 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHKAP35790 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHKAP35790 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHKAP35790 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHKAP35790 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHKAP35790 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHKAP35790 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHKAP35790 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHKAP35790 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHKAP35790 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHKAP35790 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHKAP35790 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHKAP35790 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHKAP35790 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHKAP35790 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHKAP35790 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHKAP35790 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHKAP35790 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHKAP35790 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHKAP35790 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHKAP35790 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHKAP35790 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHKAP35790 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHKAP35790 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHKAP35790 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHKAP35790 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHKAP35790 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHKAP35790 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHKAP35790 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHKAP35790 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHKAP35790 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHKAP35790 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHKAP35790 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHKAP35790 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHKAP35790 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHKAP35790 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHKAP35790 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHKAP35790 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHKAP35790 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHKAP35790 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHKAP35790 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHKAP35790 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHKAP35790 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHKAP35790 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHKAP35790 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHKAP35790 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHKAP35790 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHKAP35790 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHKAP35790 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHKAP35790 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHKAP35790 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHKAP35790 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHKAP35790 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHKAP35790 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHKAP35790 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKAP35790 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKAP35790 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKAP35790 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKAP35790 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKAP35790 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKAP35790 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKAP35790 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269.5 ms