Protein–RNA interactions for Protein: P35613

BSG, Basigin, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSGP35613 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BSGP35613 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BSGP35613 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BSGP35613 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BSGP35613 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BSGP35613 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BSGP35613 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BSGP35613 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BSGP35613 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BSGP35613 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BSGP35613 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BSGP35613 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BSGP35613 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BSGP35613 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BSGP35613 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BSGP35613 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BSGP35613 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BSGP35613 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BSGP35613 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BSGP35613 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BSGP35613 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BSGP35613 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BSGP35613 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BSGP35613 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BSGP35613 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BSGP35613 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BSGP35613 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BSGP35613 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BSGP35613 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BSGP35613 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BSGP35613 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BSGP35613 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BSGP35613 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BSGP35613 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BSGP35613 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BSGP35613 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BSGP35613 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BSGP35613 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BSGP35613 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BSGP35613 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BSGP35613 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BSGP35613 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BSGP35613 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BSGP35613 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BSGP35613 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BSGP35613 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BSGP35613 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BSGP35613 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BSGP35613 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BSGP35613 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BSGP35613 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BSGP35613 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BSGP35613 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BSGP35613 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BSGP35613 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BSGP35613 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BSGP35613 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BSGP35613 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSGP35613 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSGP35613 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BSGP35613 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSGP35613 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSGP35613 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSGP35613 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BSGP35613 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSGP35613 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSGP35613 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BSGP35613 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSGP35613 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSGP35613 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSGP35613 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSGP35613 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSGP35613 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSGP35613 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSGP35613 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSGP35613 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSGP35613 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSGP35613 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSGP35613 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSGP35613 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSGP35613 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSGP35613 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSGP35613 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSGP35613 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSGP35613 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSGP35613 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSGP35613 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSGP35613 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSGP35613 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSGP35613 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSGP35613 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSGP35613 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSGP35613 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSGP35613 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSGP35613 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSGP35613 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSGP35613 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSGP35613 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSGP35613 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BSGP35613 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms