Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD12P35452 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXD12P35452 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD12P35452 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD12P35452 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms