Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPA3P35244 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPA3P35244 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPA3P35244 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPA3P35244 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPA3P35244 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPA3P35244 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPA3P35244 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPA3P35244 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPA3P35244 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPA3P35244 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPA3P35244 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPA3P35244 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPA3P35244 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPA3P35244 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPA3P35244 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPA3P35244 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPA3P35244 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPA3P35244 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPA3P35244 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RPA3P35244 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPA3P35244 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPA3P35244 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPA3P35244 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPA3P35244 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPA3P35244 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA3P35244 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA3P35244 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA3P35244 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA3P35244 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA3P35244 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA3P35244 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA3P35244 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA3P35244 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA3P35244 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA3P35244 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA3P35244 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA3P35244 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA3P35244 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA3P35244 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA3P35244 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPA3P35244 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPA3P35244 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPA3P35244 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPA3P35244 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPA3P35244 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPA3P35244 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPA3P35244 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPA3P35244 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPA3P35244 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPA3P35244 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPA3P35244 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPA3P35244 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPA3P35244 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPA3P35244 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPA3P35244 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPA3P35244 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPA3P35244 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPA3P35244 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPA3P35244 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPA3P35244 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPA3P35244 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPA3P35244 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPA3P35244 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPA3P35244 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPA3P35244 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPA3P35244 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPA3P35244 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPA3P35244 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPA3P35244 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPA3P35244 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPA3P35244 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPA3P35244 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPA3P35244 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPA3P35244 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPA3P35244 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPA3P35244 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPA3P35244 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPA3P35244 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPA3P35244 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPA3P35244 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPA3P35244 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPA3P35244 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPA3P35244 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPA3P35244 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPA3P35244 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPA3P35244 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPA3P35244 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPA3P35244 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPA3P35244 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPA3P35244 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPA3P35244 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPA3P35244 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPA3P35244 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPA3P35244 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPA3P35244 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPA3P35244 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPA3P35244 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPA3P35244 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPA3P35244 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms