Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCM5P33992 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCM5P33992 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCM5P33992 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCM5P33992 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCM5P33992 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCM5P33992 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCM5P33992 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCM5P33992 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
MCM5P33992 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCM5P33992 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCM5P33992 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM5P33992 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM5P33992 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM5P33992 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM5P33992 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM5P33992 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM5P33992 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM5P33992 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM5P33992 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCM5P33992 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCM5P33992 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCM5P33992 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCM5P33992 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCM5P33992 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
MCM5P33992 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCM5P33992 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MCM5P33992 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCM5P33992 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCM5P33992 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCM5P33992 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCM5P33992 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCM5P33992 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCM5P33992 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM5P33992 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM5P33992 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM5P33992 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM5P33992 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM5P33992 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCM5P33992 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCM5P33992 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCM5P33992 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCM5P33992 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCM5P33992 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCM5P33992 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MCM5P33992 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCM5P33992 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCM5P33992 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MCM5P33992 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MCM5P33992 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCM5P33992 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCM5P33992 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCM5P33992 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM5P33992 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM5P33992 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM5P33992 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM5P33992 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM5P33992 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MCM5P33992 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MCM5P33992 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCM5P33992 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
MCM5P33992 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCM5P33992 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCM5P33992 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCM5P33992 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCM5P33992 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCM5P33992 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCM5P33992 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCM5P33992 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MCM5P33992 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM5P33992 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM5P33992 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM5P33992 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM5P33992 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM5P33992 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM5P33992 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM5P33992 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM5P33992 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM5P33992 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM5P33992 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM5P33992 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM5P33992 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCM5P33992 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCM5P33992 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCM5P33992 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCM5P33992 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCM5P33992 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCM5P33992 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCM5P33992 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCM5P33992 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCM5P33992 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCM5P33992 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCM5P33992 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MCM5P33992 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCM5P33992 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCM5P33992 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCM5P33992 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCM5P33992 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCM5P33992 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCM5P33992 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms