Protein–RNA interactions for Protein: P31025

LCN1, Lipocalin-1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P31025 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCN1P31025 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCN1P31025 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCN1P31025 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCN1P31025 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCN1P31025 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCN1P31025 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCN1P31025 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN1P31025 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN1P31025 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN1P31025 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN1P31025 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN1P31025 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN1P31025 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN1P31025 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN1P31025 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN1P31025 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN1P31025 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN1P31025 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN1P31025 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN1P31025 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN1P31025 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN1P31025 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN1P31025 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCN1P31025 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCN1P31025 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCN1P31025 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCN1P31025 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCN1P31025 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCN1P31025 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCN1P31025 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCN1P31025 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCN1P31025 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCN1P31025 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCN1P31025 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LCN1P31025 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCN1P31025 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCN1P31025 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCN1P31025 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCN1P31025 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LCN1P31025 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCN1P31025 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LCN1P31025 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCN1P31025 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN1P31025 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN1P31025 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN1P31025 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN1P31025 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN1P31025 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN1P31025 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN1P31025 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN1P31025 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN1P31025 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN1P31025 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN1P31025 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN1P31025 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN1P31025 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN1P31025 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN1P31025 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN1P31025 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN1P31025 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN1P31025 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN1P31025 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN1P31025 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN1P31025 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN1P31025 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN1P31025 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN1P31025 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN1P31025 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN1P31025 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN1P31025 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN1P31025 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN1P31025 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN1P31025 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN1P31025 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN1P31025 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN1P31025 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN1P31025 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCN1P31025 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN1P31025 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN1P31025 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN1P31025 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN1P31025 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN1P31025 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN1P31025 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN1P31025 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN1P31025 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN1P31025 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN1P31025 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN1P31025 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN1P31025 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN1P31025 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCN1P31025 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LCN1P31025 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN1P31025 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN1P31025 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN1P31025 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN1P31025 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN1P31025 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN1P31025 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms