Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSMA3P25788 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMA3P25788 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms