Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3P19429 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNI3P19429 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms