Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF2P15336 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF2P15336 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF2P15336 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF2P15336 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF2P15336 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF2P15336 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF2P15336 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF2P15336 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF2P15336 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF2P15336 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF2P15336 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF2P15336 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF2P15336 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF2P15336 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF2P15336 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF2P15336 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF2P15336 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF2P15336 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF2P15336 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF2P15336 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF2P15336 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF2P15336 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF2P15336 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF2P15336 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF2P15336 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF2P15336 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF2P15336 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF2P15336 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATF2P15336 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATF2P15336 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF2P15336 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF2P15336 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF2P15336 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF2P15336 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF2P15336 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF2P15336 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF2P15336 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF2P15336 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF2P15336 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF2P15336 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF2P15336 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF2P15336 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF2P15336 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF2P15336 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF2P15336 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF2P15336 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF2P15336 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF2P15336 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF2P15336 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF2P15336 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF2P15336 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF2P15336 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF2P15336 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF2P15336 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF2P15336 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF2P15336 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF2P15336 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF2P15336 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF2P15336 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF2P15336 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF2P15336 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF2P15336 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF2P15336 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF2P15336 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF2P15336 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF2P15336 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ATF2P15336 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF2P15336 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF2P15336 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF2P15336 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF2P15336 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF2P15336 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF2P15336 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF2P15336 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF2P15336 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF2P15336 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF2P15336 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF2P15336 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF2P15336 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF2P15336 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF2P15336 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF2P15336 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF2P15336 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF2P15336 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF2P15336 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF2P15336 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF2P15336 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF2P15336 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF2P15336 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF2P15336 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF2P15336 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF2P15336 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF2P15336 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF2P15336 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF2P15336 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF2P15336 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF2P15336 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATF2P15336 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATF2P15336 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms